dc.contributor.advisor	Cruz Roa, Angel Alfonso
dc.contributor.advisor	Corredor Prada, Germán
dc.contributor.advisor	Romero Castro, Eduardo
dc.contributor.author	Diaz Mejia, Darwin Sebastian
dc.date.accessioned	2023-12-01T15:22:59Z
dc.date.available	2023-12-01T15:22:59Z
dc.date.issued	2018
dc.description	Incluye figuras y tablas	spa
dc.description.abstract	En este documento se presenta el desarrollo de una plataforma Web de telepatología para la navegación eficiente de láminas virtuales de histopatología como apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en cáncer. Este trabajo tiene como base la primera versión del microscopio virtual Web desarrollado por el grupo CIM@LAB 1 de la Universidad Nacional de Colombia. A partir de esa versión, se realizó un análisis de los diferentes módulos del proyecto entregado, se estudiaron las tecnologías utilizadas y se identificó la arquitectura general del sistema. La plataforma Web de telepatología, presenta un conjunto de herramientas adicionales para el manejo de las anotaciones sobre las láminas virtuales de histopatología cuyo objetivo es el apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en el área del cáncer. Entre el conjunto de herramientas podemos hallar la gestión de anotaciones desde una base de datos, implementación de perfiles y roles para el control de los usuarios. Además presenta mejoras en el módulo del decodificador de imágenes del formato JPEG2000 (JasPer), esta mejora permite dar un mayor soporte para el acceso a la navegación de las láminas virtuales de histopatología por múltiples usuarios. Asimismo se implementaron y se ejecutaron dos pruebas para medir el desempeño de la plataforma, la primera constó de navegaciones concurrentes simuladas y la segunda constó del manejo por parte de usuarios reales.	spa
dc.description.abstract	This document presents the development of a telepathology Web platform for the efficient navigation of whole-slide histopathology images as support for teaching, research and collaborative work in cancer. This work is based on the first version of the Web virtual microscope developed by CIM@LAB research group from the Universidad Nacional de Colombia. Starting from that version, an analysis of the different modules of the project delivered was made, the technologies used were studied and the general architecture of the system was identified. The Telepathology Web platform presents a set of additional tools for the management of annotations on whole-slide histopathology images to support teaching, research and collaborative work in the area of cancer. Among the toolset we can find the management of annotations from a database, implementation of profiles and roles for the control of the users. In addition, it presents improvements in the module of the image decoder of JPEG2000 format (JasPer), this improvement allows to give a greater support for he access to the navigation of the whole-slide histopathology images by multiple users. Also, two tests were implemented and executed to measure the performance of the platform, the first consisted of concurrent simulated navigations and the second consisted of usability by real users.	eng
dc.description.degreelevel	Pregrado	spa
dc.description.degreename	Ingeniero(a) de Sistemas	spa
dc.description.program	Ingeniería de Sistemas	spa
dc.description.tableofcontents	Introducción. -- Objetivos. -- Objetivo general. -- Objetivos específicos. -- Marco referencial. -- Contextual. -- Cáncer. -- Histopatología. -- Marco teórico. -- Láminas virtuales de histopatología (Whole Slide Images, WSI). -- Códecs JPEG2000. -- Patología digital. -- Telepatología. -- Marco legal. -- Bioética y anonimización. -- Telemedicina. -- Datos personales. -- Metodología. -- Desarrollo del modelo general. -- Construcción de la lista de funcionalidades. -- Planeación por funcionalidad. -- Diseño y construcción por funcionalidad. -- Implementación de la librería JasPer en su versión actual estable para el módulo decodificador. -- Diseño de experimentos de concurrencia. -- Diseño de experimentos de usabilidad. -- Diseño e implementación de base de datos. -- Módulo de autenticación y registro de usuarios. -- Módulo de perfil de usuarios. -- Gestión de anotaciones desde una base de datos. -- Resultados. -- Fase de experimentación de concurrencia. -- Fase de experimentación de usabilidad. -- Plataforma web de telepatología. -- Conclusiones. -- Referencias y bibliografía.	spa
dc.format.extent	48 páginas	spa
dc.format.mimetype	application/pdf	spa
dc.identifier.citation	Diaz Mejía, Darwin S. (2018). Plataforma web de telepatología para la navegación eficiente de láminas virtuales de histopatología como apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en cáncer [Trabajo de grado, Universidad de los Llanos]. Repositorio digital Universidad de los Llanos	spa
dc.identifier.instname	Universidad de los Llanos	spa
dc.identifier.reponame	Repositorio digital Universidad de los Llanos	spa
dc.identifier.repourl	https://repositorio.unillanos.edu.co/	spa
dc.identifier.uri	https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/3260
dc.language.iso	spa	spa
dc.publisher	Universidad de los Llanos	spa
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias Básicas e Ingeniería	spa
dc.publisher.place	Villavicencio	spa
dc.relation.references	C. Pardo and R. Cendales, Incidencia, mortalidad y prevalencia de Cáncer en Colombia 2007-2011, vol. 1. 2015.	spa
dc.relation.references	C. Pardo, E. de Vries, J. M. Duarte, and M. Piñeros, “Cáncer en la Unidad de Cáncer del Hospital Departamental de Villavicencio, Colombia, 2006-2008,” Rev. Colomb. Cancerol., vol. 19, no. 3, pp. 125–132, Jul. 2015.	spa
dc.relation.references	L. Velásquez, G. Carrasquilla, and S. Roca-Garavito, “Equidad en el acceso al tratamiento para el cáncer de mama en Colombia,” Salud Publica Mex., vol. 51, no. 7, pp. S246–S253, 2009.	spa
dc.relation.references	J. Amaya et al., “ESTUDIO DE DISPONIBILIDAD Y DISTRIBUCIÓN DE LA OFERTA DE MÉDICOS ESPECIALISTAS, EN SERVICIOS DE ALTA Y MEDIANA COMPLEJIDAD EN COLOMBIA,” Recur. humanos salud en Colomb. Balanc. competencias y Prospect., pp. 1–135, 2013.	spa
dc.relation.references	J. Arevalo and A. Cruz-roa, “Histopathology Image Representation for Automatic Analysis : a State-of-the-Art Review Tareas De Análisis Automático : Estado Del Arte Representação De Imagens Histopatológicas Pelo Análise Automático : Revisão Do Estado Da Arte,” Revista, vol. 22, no. 2, pp. 79–91, 2014.	spa
dc.relation.references	A. Madabhushi, “Digital pathology image analysis: opportunities and challenges,” Imaging Med, vol. 1, no. 1, pp. 7–10, 2009.	spa
dc.relation.references	A. Cruz, “Data-driven Representation Learning from Histopathology Image Databases to Support Digital Pathology Analysis,” vol. 1, p. 164, 2015.	spa
dc.relation.references	A. Evans, A. Al Habeeb, and D. Ghazarian, “Virtual microscopy using wholeslide imaging as an enabler for teledermatopathology: A paired consultant validation study,” J. Pathol. Inform., vol. 3, no. 1, p. 2, 2012.	spa
dc.relation.references	N. Farahani, M. Riben, A. J. Evans, and L. Pantanowitz, “International Telepathology: Promises and Pitfalls,” Pathobiology, vol. 83, no. 2–3. Karger Publishers, pp. 121–126, 2016.	spa
dc.relation.references	R. Marée et al., “A rich internet application for remote visualization and collaborative annotation of digital slides in histology and cytology,” Diagn. Pathol., vol. 8, no. Suppl 1, p. S26, 2013.	spa
dc.relation.references	Institute, N. C. (s.f.). National Cancer Institute.	spa
dc.relation.references	Institute, N. C. (05 de 03 de 2015). National Cancer Institute.	spa
dc.relation.references	Institute, N. C. (06 de 03 de 2015). National Cancer Institute.	spa
dc.relation.references	Canceronline. (s.f.). Canceronline. Recuperado el 15 de 03 de 2017	spa
dc.relation.references	R. Vallejo, “Coloraciom hematoxilina eosina y medios de montaje,” SlideShare, 2013. [Online]. Available: https://es.slideshare.net/RosiVallejo/coloraciom-hematoxilina-eosina-y-medios-de-montaje. [Accessed: 15-Feb-2018].	spa
dc.relation.references	L. Pantanowitz et al., “Review of the current state of whole slide imaging in pathology.,” J. Pathol. Inform., vol. 2, no. around 1999, p. 36, 2011.	spa
dc.relation.references	M. García, G. Bueno, C. Peces, J. González, and M. V. Carbajo, “CLASIFICACIÓN DE SISTEMAS DE DIGITALIZACIÓN COMPONENTES DE LOS SISTEMAS DE DIGITALIZACIÓN COMPLETA DE PREPARACIONES,” Digit. slides Pathol. Dep. (II). An Anal. Exist. Solut., vol. 38, pp. 207–220, 2005.	spa
dc.relation.references	M. G. Rojo, “Normalización e interoperabilidad en Telepatología,” Lat. Am. J. Telehealth, vol. 0, no. 0, 2016.	spa
dc.relation.references	M. D. Adams, “The JPEG - 2000 Still Image Compression Standard,” pp. 1– 16, 2013.	spa
dc.relation.references	W. Palmer, P. May, and P. Cliff, “An Analysis of Contemporary JPEG2000 Codecs for Image Format Migration,” Int. Conf. Preserv. Digit. Objects, 2013.	spa
dc.relation.references	C. Daniel et al., “Standardizing the use of whole slide images in digital pathology,” Comput. Med. Imaging Graph., vol. 35, no. 7, pp. 496–505, 2011.	spa
dc.relation.references	M. N. Gurcan, L. E. Boucheron, A. Can, A. Madabhushi, N. M. Rajpoot, and B. Yener, “Histopathological image analysis: a review.,” IEEE reviews in biomedical engineering, vol. 2. IEEE, pp. 147–171, 2009.	spa
dc.relation.references	T. J. Fuchs and J. M. Buhmann, “Computational pathology: Challenges and promises for tissue analysis,” Computerized Medical Imaging and Graphics, vol. 35, no. 7–8. pp. 515–530, 2011.	spa
dc.relation.references	N. Farahani and L. Pantanowitz, “Overview of Telepathology,” Surgical Pathology Clinics, vol. 8, no. 2. Elsevier Inc., April 03, 2015, pp. 223–231, 2015.	spa
dc.relation.references	A. M. González López, “Las TIC como factor de Cambio,” 2011.	spa
dc.relation.references	Salud, M. d. (04 de 09 de 1993). MinSalud.	spa
dc.relation.references	CONGRESO COLOMBIANO, “Ley 1419 13 DIC 2010.” pp. 1--6, 2010.	spa
dc.relation.references	R. A. A. Bolaños and D. M. L. Gutiérrez, “Guía de implementación HL7 para sistemas de notificación obligatoria en salud pública en Colombia,” Sist. Telemática, vol. 7, no. 14, pp. 13–32, 2009.	spa
dc.relation.references	Colombia, C. R. (18 de 09 de 2012). secretaria senado.	spa
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