Examinando por Autor "Pachón García, Jorge"
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Publicación Acceso abierto Caracterización fenotípica de germoplasma de arroz (Oryza sativa L) por su respuesta bajo condiciones inducidas de subemergencia(Universidad de los Llanos, 2022) Sánchez Lozano, Karla Mindrey; Pachón García, Jorge; García Baquero, Eliud; Villalba Rey, DeicyLas inundaciones prolongadas junto con las variaciones climáticas y el deficiente drenaje de los suelos, generan condiciones de subemergencia que producen bajos porcentajes de germinación y un mal establecimiento de plantas en los cultivos de arroz. Por tal motivo y teniendo en cuenta que las variedades comerciales en Colombia no cuentan con tolerancia a inundaciones, se propuso determinar la respuesta a subemergencia en un panel de 120 genotipos pertenecientes a la colección de parentales del programa nacional de mejoramiento de arroz, en estados iniciales de desarrollo fenológico, mediante la evaluación de rasgos fenotípicos asociados con la tolerancia. Los genotipos mostraron diferencias significativas de supervivencia durante la germinación y el desarrollo vegetativo temprano en respuesta al estrés por inundación. Se identificaron tres genotipos (F 83, F-24, F-313) con tolerancia intermedia a la germinación anaerobia con porcentajes de supervivencia que variaron entre el 75,7% y el 76,7%. Adicional a esto, se identificó un genotipo (F-377) con tolerancia intermedia a la subemergencia durante el desarrollo vegetativo V4, el cual mostró un crecimiento limitado de brotes bajo el agua y una mejor recuperación en comparación a los genotipos susceptibles. Los genotipos identificados pueden considerarse fuentes promisorias de tolerancia a la inundación durante los estados iniciales del desarrollo fenológico para los programas de mejoramiento genético.Publicación Acceso abierto Evaluación fenotípica y molecular de la resistencia al virus de la Necrosis Rayada (RSNV) del arroz (Oryza sativa L.)(Universidad de los Llanos, 2021) Pineda Píñeros, Julieth Camila; Marin Colorado, Jaime Alberto; Villalva Rey, Deicy; Beltrán, Jorge; Pachón García, Jorge; García Baquero, EliudEl arroz es un grano de alimento básico para alrededor de la mitad de la población mundial, pero su productividad se ve afectada por la incidencia de distintas enfermedades. En Colombia, hacia el año de 1969 se registró la presencia del Virus de la Necrosis Rayada del Arroz (RSNV, acrónimo en inglés), esta enfermedad conlleva entre el 20% y 40% de pérdidas de rendimiento y un aumento en costos de producción hasta del 26%. Para el año 2018, FEDEARROZ registró un aumento de lotes comerciales con síntomas asociados a la enfermedad, en la zona Centro y Llanos Orientales. En el país se conocen pocos estudios que reporten genotipos resistentes a la enfermedad, lo que deja pocas alternativas para el control de este. Se evaluó la respuesta de 50 genotipos frente a la inoculación con el virus y se identificó la presencia del vector del virus, Polymyxa graminis mediante microscopía de luz y pruebas de PCR convencional.No se encontró ningún material resistente a la enfermedad, solo el material 13 presento una leve tolerancia en el primer ensayo, el resto de los genotipos resultaron ser susceptibles a esta. La identificación microscópica y molecular de P. graminis arrojó resultados positivos, encontrándose los ribotipos P. graminis f. sp. colombiana y P. graminis f. sp. tepida. La metodología de clasificación de germoplasma junto con la identificación del vector fue satisfactoria para sus fines, por lo que se recomienda usarla para posteriores evaluaciones.Publicación Acceso abierto Obtención de péptidos con posible bioactividad a partir de lodos digeridos derivados de la biodigestión anaerobia de aguas residuales(Universidad de los Llanos, 2016) Barreto Montenegro, Julian Camilo; Segura Latorre, Cesar; Pachón García, JorgeLa digestión anaerobia es un proceso fermentativo en ausencia de oxígeno llevado a cabo por comunidades microbianas. Se ha utilizado como una alternativa para el manejo de diversas fuentes residuales y para la producción de biogás. Entender las complejas interacciones y los procesos que involucran a estas comunidades microbianas es crítico para el mejoramiento de las condiciones anaerobias y buscar nuevas aplicaciones. Objetivo: Diseñar una metodología para la extracción y caracterización de péptidos derivados de la digestión anaerobia de lodos de la planta de tratamiento de aguas residuales de San Fernando (Itagüí, Antioquia). Para lograr este objetivo, el material peptídico se extrajo a partir de los lodos y se determinó la actividad antimicrobiana del extracto proteico. Metodología: Los péptidos se extrajeron mecánicamente por sonicación y se tamizaron a través de filtros moleculares de 10 KDa de peso molecular. La presencia y concentración de material proteico en los extractos (péptidos/proteínas pequeñas) se determinó por el método de Lowry. El extracto se caracterizó por cromatografía líquida de alta eficacia (HPLC), acoplado a espectrometría de masas de baja resolución (LC-MS) y electroforesis en gel (Tricina-SDS-PAGE).