Publicación: Evaluación fenotípica y molecular de la resistencia al virus de la Necrosis Rayada (RSNV) del arroz (Oryza sativa L.)
dc.contributor.advisor | Marin Colorado, Jaime Alberto | |
dc.contributor.advisor | Villalva Rey, Deicy | |
dc.contributor.advisor | Beltrán, Jorge | |
dc.contributor.author | Pineda Píñeros, Julieth Camila | |
dc.contributor.jury | Pachón García, Jorge | |
dc.contributor.jury | García Baquero, Eliud | |
dc.date.accessioned | 2024-08-14T20:06:03Z | |
dc.date.available | 2024-08-14T20:06:03Z | |
dc.date.issued | 2021 | |
dc.description | Incluye, figuras, tablas y símbolos | spa |
dc.description.abstract | El arroz es un grano de alimento básico para alrededor de la mitad de la población mundial, pero su productividad se ve afectada por la incidencia de distintas enfermedades. En Colombia, hacia el año de 1969 se registró la presencia del Virus de la Necrosis Rayada del Arroz (RSNV, acrónimo en inglés), esta enfermedad conlleva entre el 20% y 40% de pérdidas de rendimiento y un aumento en costos de producción hasta del 26%. Para el año 2018, FEDEARROZ registró un aumento de lotes comerciales con síntomas asociados a la enfermedad, en la zona Centro y Llanos Orientales. En el país se conocen pocos estudios que reporten genotipos resistentes a la enfermedad, lo que deja pocas alternativas para el control de este. Se evaluó la respuesta de 50 genotipos frente a la inoculación con el virus y se identificó la presencia del vector del virus, Polymyxa graminis mediante microscopía de luz y pruebas de PCR convencional.No se encontró ningún material resistente a la enfermedad, solo el material 13 presento una leve tolerancia en el primer ensayo, el resto de los genotipos resultaron ser susceptibles a esta. La identificación microscópica y molecular de P. graminis arrojó resultados positivos, encontrándose los ribotipos P. graminis f. sp. colombiana y P. graminis f. sp. tepida. La metodología de clasificación de germoplasma junto con la identificación del vector fue satisfactoria para sus fines, por lo que se recomienda usarla para posteriores evaluaciones. | spa |
dc.description.degreelevel | Pregrado | |
dc.description.degreename | Biólogo | |
dc.description.tableofcontents | Resumen. -- Lista de figuras. -- Lista de tablas. -- Lista de símbolos y abreviaturas. -- Planteamiento del problema. – Objetivos. -- Objetivo general. -- Objetivos específicos. – Justificación. -- Marco teórico. -- Antecedentes e historia de la enfermedad. – Síntomas. -- El virus. -- Polymyxa graminis. -- Identificación de la enfermedad. – Metodología. -- Método de inoculación y reproducción de la enfermedad. -- Descripción fenotípica. -- Selección de los materiales. -- Desinfección de semilla. – Pregerminación. -- Primera evaluación. -- Segunda evaluación. -- Identificación microscópica del vector. -- Verificación molecular del vector por PCR. -- Extracción de ADN. – PCR. -- Análisis estadístico. -- Resultados. -- Materiales para evaluar. -- Descripción fenotípica. -- Primera evaluación. -- Degradación a través del tiempo de 52 genotipos. -- Clasificación parcial de genotipos. -- Segunda evaluación. -- Clasificación final de 9 genotipos. -- Degradación a través del tiempo de 9 genotipos. -- Análisis de supervivencia. -- Identificación microscópica del vector. -- Identificación molecular del protista vector. -- Discusión. -- Conclusiones. -- Bibliografía. | spa |
dc.format.extent | 117 páginas | |
dc.format.mimetype | application/pdf | |
dc.identifier.citation | Pineda, Piñeros, Julieth C,. 2021). Evaluación fenotípica y molecular de la resistencia al virus de la Necrosis Rayada (RSNV) del arroz (Oryza sativa L.) [Trabajo de grado, Universidad de los Llanos]. Repositorio digital Universidad de los Llanos. | |
dc.identifier.instname | Universidad de los Llanos | |
dc.identifier.reponame | Repositorio digital Universidad de los Llanos | |
dc.identifier.repourl | https://repositorio.unillanos.edu.co | |
dc.identifier.uri | https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/4134 | |
dc.language.iso | spa | |
dc.publisher | Universidad de los Llanos | |
dc.publisher.branch | Sede Barcelona | |
dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias Básicas e Ingeniería | |
dc.publisher.place | Villavicencio | |
dc.publisher.program | Biología | |
dc.relation.references | Andika, I. B., Kondo, H., Sun, L., & Burch-smith, T. M. (2016). Interplays between Soil-Borne Plant Viruses and RNA Silencing-Mediated Antiviral Defense in Roots. 7(September), 1–13. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.01458 | |
dc.relation.references | Barr, D. J. S. (1979). Morphology and host range of polymyxa graminis, polymyxa betae, and ligniera pilorum from ontario and some other areas. Canadian Journal of Plant Pathology, 1(2), 85–94. https://doi.org/10.1080/07060667909501468 | |
dc.relation.references | Bastidas, H., Montealegre, F. (1994). Aspectos generales de la nueva enfermedad llamada entorchamiento. Arroz, 398, 30–35. | |
dc.relation.references | Calvert, L., Sedano, F. (2001). Characterization of Crinkling Disease: A complex of Polymyxa graminis and Rice Stripe Ncerosis Virus. Annual Report 2001 Project IP-4, 156–161. | |
dc.relation.references | Cox, B. A., Luo, H., Jones, R. A. (2014). Polymyxa graminis Isolates from Australia : Identification in Wheat Roots and Soil , e - X tra * Polymyxa graminis Isolates from Australia : Identification in Wheat Roots and Soil , Molecular Characterization , and Wide Genetic Diversity. Plant Disease, 98, 1567–1575. https://doi.org/10.1094/PDIS-02-14-0128- RE | |
dc.relation.references | Degiovanni, V., Berrio, L., & Charry, R. (2010). Origen , taxonomía , anatomía y morfología de la planta de arroz ( Oryza sativa L .). Producción Eco-Eficiente Del Arroz En América Latina, 35–59. https://ciat-library.ciat.cgiar.org/Articulos_Ciat/2010_Degiovanni- Produccion_eco-eficiente_del_arroz.pdf | |
dc.relation.references | Echeverri, J., & Valdes, P. (2002). Métodos de inoculación del virus (VRNA) de la Necrosis Rayada del Arroz (Entorchamiento), caracterización de poblacione derivadas de un cruzamiento interespecífico por su resistencia al vector y/o al virus y su control químico. [Universidad Nacional de Colombia]. In Universidad Nacional de Colombia. https://doi.org/10.1590/S1516-18462008000300012 | |
dc.relation.references | Fauquet, C. Thouvenel, J.-C., Fargette, D., & Fishpool, L. D. C. (1988). Rice stripe necrosis virus: a soil-borne rod-shaped virus. 71–82. | |
dc.relation.references | Gnanamanickam, S. (2009). Major Diseases of Rice. In Biological Control of Rice Diseases (Issue November, pp. 13–36). | |
dc.relation.references | IRRI. (2002). Standard Evaluation System for Rice (SES). | |
dc.relation.references | Kanyuka, K., Ward, E., & Adams, M. J. (2003). Polymyxa graminis and the cereal viruses it transmits: a research challenge. Molecular Plant Pathology, 4(5), 393–406. https://doi.org/10.1046/j.1364- 3703.2003.00177.x | |
dc.relation.references | Legréve, A., Delfosse, P., & Maraite, H. (1998). Differences in temperature requirements between Polymyxa sp. of Indian origin and Polymyxa graminis and Polymyxa betae from temperate areas. European Journal of Plant Pathology, 104(2), 195–205. https://doi.org/10.1023/A:1008612903927 | |
dc.relation.references | Legrève, A., Delfosse, P., & Maraite, H. (2002). Phylogenetic analysis of Polymyxa species based on nuclear 5 n 8S and internal transcribed spacers ribosomal DNA sequences. Mycology Research, 106(2), 138– 147. | |
dc.relation.references | Lozano, I., & Morales, F. (2009). Molecular characterisation of Rice stripe necrosis virus as a new species of the genus Benyvirus Molecular characterisation of Rice stripe necrosis virus as a new species of the genus Benyvirus. European Journal of Plant Pathology, 124, 673–680. https://doi.org/10.1007/s10658-009-9453-z | |
dc.relation.references | Morales, F., Ward, E., Castaño, M., Arroyave, J., Lozano, I., & Adams, M. (1999). Emergence and partial characterization of rice stripe necrosis virus and its fungus vector in South America. European Journal of Plant Pathology, 105(7), 643–650. https://doi.org/10.1002/mana.200910460 | |
dc.relation.references | Ordon, F., Habekuss, A., Kastirr, U., Rabenstein, F. Kühne, T. (2009). Virus Resistance in Cereals : Sources of Resistance , Genetics and Breeding. J Phytopathol, 545, 535–545. https://doi.org/10.1111/j.1439-0434.2009.01540.x | |
dc.relation.references | Reyes, L., Prado, G., Sedano, F., Correa, F., Morales, F., Calvert, L. (2000). Caracterización del Entorchamiento: Un complejo de Polymyxa graminis y el Virus del Rayado Necrótico del Arroz. In Informe Anual 2000 CIAT (pp. 150–157). | |
dc.relation.references | Smith, M. J., Adams, M. J., & Ward, E. (2013). Ribosomal DNA analyses reveal greater sequence variation in Polymyxa species than previously thought and indicate the possibility of new ribotype-host-virus associations. Environmental Microbiology Reports, 5(1), 143–150. https://doi.org/10.1111/1758-2229.12026 | |
dc.relation.references | Thompson, J., Clewett, T., Jennings, R., Sheedy, J., Owen, K., & Persley, D. (2010). Detection of Polymyxa graminis in a barley crop in Australia. Australasian Plant Pathology, 40, 66–75. https://doi.org/10.1007/s13313-010-0015-9 | |
dc.relation.references | Ward, E., Kanyuka, K., Motteram, J., Kornyukhin, D., & Adams, M. J. (2004). The use of conventional and quantitative real-time PCR assays for Polymyxa graminis to examine host plant resistance, inoculum levels and intraspecific variation. New Phytologist, 165, 875–885. https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2004.01291.x | |
dc.relation.references | Ward, E., & Adams, J. (1998). Analysis of ribosomal DNA sequences of Polymyxa species and related fungi and the development of genus- and species- specific PCR primers. Mycol. Res., 102(8), 965–974. https://doi.org/10.1017/S0953756297005881 | |
dc.relation.references | Ward, E., Adams, M., Mutasa, E., Collier, C., & Asher, J. (1994). Characterization of Polymyxa species by restriction analysis of PCRamplified ribosomal DNA. Plant Pathology, 43, 872–877. | |
dc.relation.references | White, T. J. , Bruns, T., Lee, S., Taylor, J. (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In I. Academic Press (Ed.), PCR Protocols: A guide to Methods and Applications (pp. 315–322). | |
dc.relation.references | Ziegler, A., Fomitcheva, V., Zakri, A. M., & Kastirr, U. (2016). Occurrence of Polymyxa graminis Ribotypes in Germany and Their Association with Different Host Plants and Viruses. Cereal Research Communications, 44(2), 251–262. https://doi.org/10.1556/0806.43.2015.051 | |
dc.rights | Derechos reservados - Universidad de los Llanos, 2021 | spa |
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dc.rights.license | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/ | |
dc.subject.proposal | Oryza Sativa | eng |
dc.subject.proposal | Polymyxa graminis | eng |
dc.subject.proposal | RSNV | eng |
dc.subject.proposal | Germoplasma | spa |
dc.subject.proposal | Resistencia/tolerancia | spa |
dc.title | Evaluación fenotípica y molecular de la resistencia al virus de la Necrosis Rayada (RSNV) del arroz (Oryza sativa L.) | spa |
dc.type | Trabajo de grado - Pregrado | |
dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f | |
dc.type.coarversion | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |
dc.type.content | Text | |
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