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Examinando por Materia "phylogeny"

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    Revisión sistemática y análisis filogenético de los aislamientos de SARS-CoV-2 en perros y gatos domésticos del mundo
    (Universidad de los Llanos, 2021-12-16) Jaramillo-Hernández, Dumar A.; Velásquez-Peña, María A.; Chacón-García, María C.
    La constante investigación respecto al coronavirus tipo 2 causante del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) requiere de revisiones periódicas en las que se concentre información reciente y relevante. El objetivo de éste estudio fue realizar una revisión sistemática epidemiológica del SARSCoV-2 en caninos y felinos domésticos, así como el análisis filogenético de las secuencias genéticas del virus aisladas de perros y gatos del mundo, reportadas en la plataforma GISAID. La revisión sistemática se estructuró a partir del protocolo PRISMA. Las palabras claves utilizadas fueron: SARSCoV-2, COVID-19, caninos, felinos, animales de compañía, reservorios animales y zoonosis. Adicionalmente, se seleccionaron todas las secuenciaciones genéticas del SARS-CoV-2 aisladas de perros y gatos alrededor del mundo, publicadas en la base de datos “EpiCov” de la plataforma GISAID, las cuales fueron analizadas a través de la plataforma Nextclade para la generación de los árboles filogenéticos respectivos. En cuanto a los resultados, en el mundo se ha reportado el aislamiento de material génico del SARS-CoV-2 en 99 perros y 108 gatos infectados naturalmente con éste virus. Además, existe un total mundial de 133 secuencias genéticas de SARS-CoV-2 en caninos (45) y felinos (88) domésticos reportadas en GISAID, donde las variantes preocupantes (VOC) (Alpha y Delta) y las variantes de interés (Iota y Lambda) para la salud pública según la OMS, han sido aisladas. Por otra parte, el linaje viral B.1. ha sido el de mayor predominancia tanto en caninos como en felinos (13,3%) y los clados Nextstrain 19A (24,1%) y GISAID GH (32,3%) los de mayor frecuencia, así como Norteamérica la región con mayor cantidad de genomas de SARS-CoV-2 aislados de caninos y felinos domésticos (40,1%). En conclusión, los caninos y felinos domésticos son susceptibles a la infección por SARS-CoV-2, probablemente gracias a un efecto de spillover desde el ser humano. Debido a su baja capacidad de transmitir el virus a otras especies animales, los animales de compañía pueden considerarse un fondo de saco epidemiológico en la dinámica de transmisión del virus. Por último, que las VOC Alpha y Delta lograran infectar tanto perros como gatos, es un hallazgo evidentemente significativo para la salud pública mundial y el conocimiento de la dinámica epidemiológica de éste nuevo virus.